暑期科研實習總結
201*年赴中國科學院廣州生物醫(yī)藥與健康研究院
暑期科研實踐報告
XXX
(XXX大學XXX學院XXX班)
引子
很久前就想借學院舉辦的暑期科研實踐活動走出校園,零距離去接觸真正的科研,看看科研的世界到底是怎么樣的。出于對醫(yī)學和生物學的熱愛,我在列表中選擇了廣州生物醫(yī)藥與健康研究院。并開始做聯(lián)系的準備。一開始了解到研究院不招收低年級本科實習生,我很失望和迷茫。但身為這個實習小組的組長,除了自己特別想去,還肩負著十余名同學的實習機會。我不放棄,通過郵件電話等方式,在研究院院長和科教處老師的幫助下,終于獲得了這個機會。
通過有限的資源了解了研究院后,我選擇了XX教授的實驗組,主要研究干細胞與再生醫(yī)學,而IPS正是其中一項。并且了解到國內iPS的研究在國際上不落人后,某些領域還處于領先地位,來自中科院廣州生物醫(yī)藥與健康研究院的裴端卿教授就是其中突出的耕耘者之一。
第一次接觸可誘導的多能干細胞(IPS)是在XX老師的細胞生物學這門課上,課間五分鐘小演講中一位同學提到的。IPS是通過在分化的體細胞中表達特定的轉錄因子以誘導體細胞的重編程而獲得的可不斷自我更新且具有多向分化潛能的細胞。干細胞的培養(yǎng)與運用在醫(yī)學領域有著舉足輕重的作用,近年來iPS的發(fā)現(xiàn)與發(fā)展更是為人類疾病的治療,也為胚胎干細胞應用上的倫理道德問題找到了一個出路。我對這個領域的研究很有興趣,想深入學習相關內容,于是抓住了這個機會。
初來乍到
就這樣,懷著興奮和好奇,7月21日,我跨進了研究院的大門。第一印象:非常安靜和整潔,一切都那么井然有序,又仿佛能感覺到大腦急轉的步伐和思想碰撞的聲音。我知道,在這份安靜底下,其實很多人在緊鑼密鼓地忙碌著。
辦完報到手續(xù)之后,在實驗室小組長陳捷凱師兄的帶領下,我來到了“體細胞重編程研究組”。邊聽著師兄的介紹,我打量著這塊地盤。寬敞的分子實驗平臺和看起來“機關重重”的細胞間,就在實驗室對面的研究員辦公室,以及位于樓層另一邊的電子閱覽室,我那為期24天的暑期科研實踐就將在這三點一面鋪展開來。
到這工作不久的XX師兄很熱情地接待我們,在這個人生地不熟的地方,頓時感覺很親切。師兄簡單地跟我們交流了生物學的一些話題,介紹了IPS的概況,又教我們查閱文獻的方法和幾個很實用的網(wǎng)站,我如獲珍寶。實踐證明,這些基本的學習手段和知識在日后的實習過程中發(fā)揮了很大的作用。
實習印記拾掇讀文獻
開始的兩三天,每天的任務就是看文獻,包括全英的論文。很早就聽不少師兄姐說過,去實習第一要培養(yǎng)的是讀文獻的能力,果然如此。每天都只是看論文,確實挺單調,有個別同學動搖了,甚至第二天就退出了。我覺得很可惜,同時也更堅定了自己要堅持努力的決心。
我堅信,無論做什么,用心了就總會有收獲,眼光也不能只放在當下。面對一個對自己
來說幾乎是全新的東西,花時間先去了解它那是必須的,為以后更深入的學習和實踐打下基礎,這很合理。否則剛開始就動手操作,也不知從何做起,就算操作很正確也只是行尸走肉不知其意義何在。另一個也是因為自己興趣所在,讀得也津津有味。累了就時常想起自己的師兄曾用三天自學完一本全英教程,以此來激勵自己。但我能力有限沒能達到那個自學水平。這幾天的埋頭閱讀,雖說不能百分百掌握所接觸的內容,但對IPS這一領域,比起以前,總算有了個較清晰的輪廓,心里有底了。交流、取經(jīng)
在學校學生工作中打拼了兩年,覺得自己適應新的環(huán)境和新面孔的能力還可以。然而在研究院實踐開始挺長的一段時間后我才感覺適應了那里的氛圍。
一開始,總覺得師兄姐們都好忙,在實驗室做完實驗,又回到辦公室對著電腦分析實驗或看文獻,相互之間似乎很少有什么要交流,但也經(jīng)常看到XX,XX師兄和XX師兄在一起討論。每個人在辦公室里那種專注和安靜竟然讓我有種想逃開的沖動,我想這是一個滿是研究人員的房間里很正常的氛圍吧,是我還沒習慣罷了。加上因為辦公室安排不下,開始的幾天又只是看文獻,大部分時間待在閱覽室,跟師兄姐接觸較少,想交流的時候又覺得不知從何問起。
后來慢慢發(fā)現(xiàn),其實是自己的主觀意識先入為主,產(chǎn)生了敬畏心理,把師兄姐們抬得太高太難以接觸了使自己把交流的主動性給丟了。而且我也再次感受到,好的交流也需要先成為朋友。后來越來越喜歡在實驗室那邊跟師兄姐們一起,發(fā)現(xiàn)其實師兄姐很愿意把自己知道的東西告訴我們,聽多了就想得多,想多了就會問得多,自然就學到了更多。你希望別人怎么對你,你就怎么對別人,包括交流也是這樣。而這一切都需要我們做到:主動。且行且思
專業(yè)知識掌握得不多,對于很多常掛在嘴邊的專業(yè)知識都聽不懂,看不明。電子閱覽室是待得最多的地方了,平時沒有實驗的時候,大多數(shù)就去那查資料,把不懂的東西搜一遍,以后在接觸到相關內容的時候就不會摸不著頭腦了,解決力所能及的問題,也不用連一些看似很常識化的專業(yè)知識都去麻煩師兄姐,在這個閱覽室,確實學到了很多東西。
在看和聽的同時,要不斷的思考,不要似懂非懂就放過去了。印象最深的就是學CHIP和甲基化檢測這兩個實驗時,原理用途步驟都弄清楚后以為都懂了,再一想,根本不知道這兩個技術是怎么服務于我們實驗組現(xiàn)在IPS的研究中的。經(jīng)過和其他師兄姐討論,整理思路,找到最終不明白的地方,然后請教XX師兄終于弄明白,當時的感覺真是柳暗花明。
失敗也是科研常遇之事。失敗不可怕,重要的是要懂得不要對自己擺架子,把心態(tài)放低去思考,尋找錯根,這時候對自己要求一定要嚴格,每一個看似不可能出錯的步驟都有可能。我們做的甲基化實驗就失敗了兩次,從所制備的試劑到實驗條件到最后PCR的引物一一懷疑,要一步一步把好關卡才能做好。并且無論多簡單的步驟都不能偷工減料,否則事倍功半。
關于做科研,感受最深的是,技術重要,但思維也很重要?蒲姓卟粌H知道怎么去做,最重要的是他知道為什么要這樣做,知道需要這樣做,他懂得怎樣運用這些技術去達到自己的目的。所以在掌握操作技術時,最重要的還是要學會去想。另外,做科研要不斷地去追尋最新的動態(tài),不能只圈在自己的小世界里,但是,在攝入別人的成果時,要記住時刻保持質疑,敢于去質疑,全信則不如不信。師兄姐們在運用別人的成果之前,總要自己先驗證,所謂實踐是檢驗真理的唯一標準,用在這里也不為過。學無止境
每周一次的小組會議也是印象比較深刻的。除了討論各自的工作進展外,還有論文的分享。我很欣賞這一點,雖然實驗組里的人都很經(jīng)常看文獻,但就算看同一篇文章也會有不同的理解和想法。每周的組會讓一個人來分析一篇較新的課題組相關的論文,讓其他成員學到自己不知道的東西,也交流了大家的想法,學習別人的思維方式。據(jù)說還會有相關的專業(yè)課
題的講授,讓我深深感受到學無止境啊。術業(yè)有專功,每個人總有自己專長的,也就肯定有自己不懂的,只有不斷地學習,才不會落后,懂得越多,也能更好的服務于自己的專長。
實習日程
時間7.21內容摘要報到了解實驗室布局了解可誘導多功能干細胞(IPS)的概況了解基本的文獻查閱、檢索方法7.2223閱讀IPS相關文獻(體細胞重編程技術,什么是IPS,IPS的發(fā)現(xiàn)過程和獲取方法,IPS的鑒定,IPS的研究方向)7.24查閱分子克隆相關內容觀摩實驗1、分子克隆的部分流程:菌落PCRDNA電泳陽性菌落擴增(保種,大提)2、質粒試劑盒抽提(小提)觀摩實驗:實時熒光定量PCR(RealTimePCR)XX師兄(實驗室小組長,博士生)暢談IPS并進行疑難解答查閱染色質免疫共沉淀(ChIP)相關內容開組會:實驗室各成員工作匯報及討論,XX師兄分享論文《epigeneticmemoryininducedpluripotentstemcells》進一步學習實時定量PCR(RealTimePCR)相關內容觀摩實驗:1、zed1基因的克隆過程2、RealTimePCR3、染色質免疫共沉淀(CHIP)部分流程:配制CHIP需用的試劑備用,加入一抗過夜操作實驗:菌落PCR(比較不同引物克隆Oct4基因的效力)查閱資料(以引物設計為主)閱讀文獻討論疑難點開組會:實驗室各成員工作匯報及討論操作實驗:Gtl2基因的甲基化檢測流程:把提好的DNA酶切獲得目的片段制作珠子用焦亞硫酸鹽處理并過夜繼續(xù)操作實驗:gtl2基因的甲基化檢測流程:洗昨天做好的珠子PCRDNA電泳實驗結果:無目的條帶,失敗可能原因分析:低熔點瓊脂糖沒完全煮融(濃度不夠);珠子沒洗干凈;PCR引物特異性不高重復操作實驗:gtl2基因的甲基化檢測實驗結果:無目的條帶,失敗7.257.267.277.287.2930查閱資料(以甲基化定量分析DNA為主)7.318.128.38.48.58.
可能原因分析:瓊脂糖有問題或是沒完全煮融;PCR引物特異性不高8.88.9查閱TRIzol提取法提取RNA的相關內容學習載體與目的片段連接的及其具體操作方法觀摩實驗:1、TRIzol提取法提取RNA2、RT-PCR操作實驗:用試劑盒提取質粒參觀研究生Poster展開組會:實驗室各成員工作匯報及討論論文分享操作實驗:流程:洗昨天師姐做好的珠子PCRDNA電泳結果:無目的條帶,失敗可能原因分析:焦亞硫酸鈉試劑有問題;引物特異性不高查閱資料觀摩實驗:轉化練習使用NCBI網(wǎng)站中的Entrez信息查詢系統(tǒng)檢索并提取人瘦素(leptin)的各種核酸序列查閱資料體驗細胞間工作環(huán)境觀摩實驗:轉導使用倒置熒光顯微鏡觀察IPS細胞及轉導過程中的細胞8.108.118.128.13查閱資料,整理資料
結束語
整個暑期實踐,掌握了IPS研究中的基本知識,了解了IPS最新的研究動態(tài)。學習了一些先進技術原理和要領,例如分子克隆,CHIP,引物設計,轉化轉導等。掌握了一些常用的技術及其操作,例如序列搜索等生物信息學內容,菌落PCR,實時定量PCR,甲基化檢測等。熟練了一些基本實驗操作,如PCR,DNA電泳等。實習給我最大的三點感觸,一是,我不再只是從別人口中聽,從別人文字中看,而是零距離接觸自己想知道的世界,親身經(jīng)歷想做的事情。二是,實習給了我主動去學習新知識的動力和毅力。三是給了我一段值得珍藏的回憶。
我沒有像師兄XX,XX,同屆同學XX等人那樣,能在《sience》上發(fā)表文章,或者在實習單位做出了很驕人的成果,但是,我覺得自己真的帶回了不少屬于自己的真切的收獲。二十多天的實習轉眼就過去了,要離開的時候,多了沉甸甸的知識,多了一群朋友,多了幾分不舍。鳴謝
感謝XX院長和輔導員XX老師,是你們搭建了這個平臺。
感謝研究院的XX院長,XX老師,是你們讓我的旅程得以順利啟航。感謝實驗組中給予我指導的各位師兄姐,是你們充實了我的旅途。感謝每天和我一起早出晚歸的同學,是你們和我并肩同行。衷心地感謝在這次實習中一起走過的所有人!
擴展閱讀:暑期科研見習崗位總結報告
暑期科研見習崗位總結報告
船舶海洋與建筑工程學院楊賀學號:5090109006指導老師:林志良201*學年暑假,為了充實自己的暑期生活,拓展自己的專業(yè)視野,積累一定的科研活動經(jīng)驗,我申請加入了林志良老師立項的暑期實踐項目《應用有限體積法模擬方腔流及臺階流問題》。在這次見習活動中,我與小組的其它三位成員圍繞著計算流體力學以及FORTRAN程序語言進行了為期一個月的學習與實踐。
項目內容:
此次項目的內容主要是學習有限差分的方法,使用了美國JohnD.Anderson編撰的經(jīng)典教材《計算流體力學基礎及其應用》;谶@本教材,我們學習了CFD的基本思想、基本方程以及基本的數(shù)值計算方法有限差分法;谝呀(jīng)在大二下學習了流體力學的基礎知識,此次研習的內容更側重于離散化的基本方法、網(wǎng)格生成與坐標變換以及計算流體力學的基本方法。
此外,CFD的發(fā)展時刻離不開計算機技術的跟進,所有的數(shù)值計算方法最終都要依賴與計算機技術去實現(xiàn)。因此,本次見習的另一重點學習內容就是FORTRAN語言的使用,通過借閱相關的書籍,逐步掌握FORTRAN語言的語法規(guī)則以及邏輯形式,最終能夠完成計算程序的編寫。
項目經(jīng)歷:
六周的見習時間主要分成前四周的小組集中討論學習以及后兩周的自主編寫程序。前四周每周一和周五下午為小組集中討論時間,由林志良老師進行基本內容的講解后,再由小組同學自行提問進行學習成果的交流與探討。后兩周由同學應用所學的數(shù)值計算方法及FORTRAN語言,針對特定的問題進行程序的編寫。
在前四周的學習中,我們用兩周的時間經(jīng)行了教材第一部分即前三章的學習,復習了計算流體力學的控制方程并掌握了偏微分方程的一些基本知識。在大二下學期初學流體力學的時候,課堂上教授的內容更多的側重于整個流體力學體系的構建,涉及的內容廣泛而淺顯,許多的問題都是采用最簡化的方式近似出物理模型,流體通常都假定無粘不可壓等。在第一周的流體力學方程的回顧中,我們回到最原始的流體問題,沒有采取任何近似而進行方程的推導,回歸最本質的NS方程,僅由質量、動量和能量三者構建出流動模型進行推導。最后才根據(jù)不同的情況需要作適當?shù)暮喕,得到適合CFD使用的控制方程。
第二周進行偏微分方程的推導時,教材僅涉及了偏微分方程的類型及其相對應的性質,我們在圖書館找到有關偏微分方程的書籍進行了更加深入的補充學習,在討論中不僅就書上不理解的問題進行反復爭論,也一起找出相關數(shù)學知識不足的缺口,在老師的引導下制定出詳實的補充書目清單,并會在之后的學習中不斷跟進。
第三周我們開始接觸離散化的基本方法,對于有限差分方法進行了初步的學習,了解到了隱式方法和顯示方法并推導出不同穩(wěn)定性方法下的誤差條件。這其中對于誤差的分析既是難點也是重點,然而由于數(shù)學知識的不足我們只能淺嘗輒止,還有賴于之后對于偏微分方程、離散數(shù)學等知識的補充才能更深入的進行數(shù)值計算后的誤差分析。
第四周我們學習的是網(wǎng)格的構件,這主要還是停留在理論上坐標變換的部分,如何將曲面上的網(wǎng)格變換成平面方形格的方程推導,實際的計算機操作還要在之后的軟件學習中進一步深入。之后我們還討論式的學習了CFD的基本方法,它們都直接應用了最原始的有限差分方法,精度較低,然而卻讓我們了解到了CFD最基本的方法構成,是今后對于現(xiàn)今CFD高級方法學習的必不可少的先修課程。
最后兩周,我們嘗試用FORTRAN語言編寫有關于隱式格式的一個小程序,作為此次見習活動的實踐內容及總結匯報。盡管編的程序還需要借鑒一部分現(xiàn)有的公式語言,我們已經(jīng)初次體驗到了數(shù)值計算與編程之間微妙的相互作用,認識到了計算機技術對于數(shù)值計算的強大輔助作用。
項目成果:
此次見習中,我們掌握了計算流體力學的基本理論知識。對于流體力學的知識有了更加深入的理解,尤其是對于流體力學基本控制方程有了更加全面的解讀。對于新接觸的數(shù)值計算方法,了解了最基礎的數(shù)值分析理論,為今后更為深入的學習更為深入、前沿的數(shù)值計算方法打下基礎。
在軟件的應用上,掌握了FORTRAN語言的基本編寫模式,能夠使用FORTRAN語言編寫小的計算程序。
見習體會:
這次見習活動歷時一個多月,是我第一次走進實驗室進行科研活動,開始接觸計算流體力學這個研究方向。從知識積累上來看,我收獲頗豐,不僅是在老師的引導下學習一門新學科的基礎知識,更多的是開始嘗試自主探究去學習自己感興趣的內容。暑假的時間十分充裕,我們每個星期除了定期的開會討論之外,有充分的自主支配時間,我們可以選擇去實驗室進行上機編程也可以選擇去圖書館看書查資料。我們基本上都是自己安排學習時間,在完成基本教材的學習任務后,還選擇性的看一些數(shù)值分析、計算方法類的書籍,養(yǎng)成了自覺探究學習,有針對性目的性的學習習慣。
另外,就專業(yè)方向上來看,此次見習活動也大有裨益。在大二上學期專業(yè)分流之后,我們只進行了一個學期的專業(yè)學習,對于船舶與海洋工程這個博大精深的專業(yè)還是知之甚少。在這次見習之中,我們才逐漸了解到專業(yè)的細分程度竟然如此之高,僅僅一個流體力學的數(shù)值研究也包含了構建網(wǎng)格、解析方法等等分支,其中每一個方向都會使我們付出一生都不能窮其究竟。這使我開始真正的了解到科學研究的嚴謹細致,開始對自己的專業(yè)規(guī)劃有了新的想法,希望能通過這樣的見習活動多接觸自己有興趣的領域,在今后的學術發(fā)展中能找到最適合自己的專業(yè)方向。
最后,此次見習活動對我影響最大的還是在于對待科學研究的態(tài)度。在前兩年的本科學習中,我已經(jīng)習慣了按照教務處安排的課表每天學習固定的課本,緊跟著老師的進度寫作業(yè)、參加考試。然而,這一次的見習活動讓我認識到,真正做科研的人需要有著明確的研究方向,并由此決定自己學習知識的內容。在進行了兩年的本科學習之后,倘若現(xiàn)在像暑假一樣每天都是自由的時間由我決定每天的研究內容和任務,我會覺得無所適從。當我看到老師和研究生們整日沒有培養(yǎng)計劃的束縛卻還在通宵達旦調試程序的時候,我第一次意識到自己做科研的第一步才剛剛邁下。我需要的是踏實嚴謹?shù)闹螌W態(tài)度,明確自己的興趣所在并扎扎實實地投身其中,腳踏實地的規(guī)劃自己的學術進度。
我希望,這次見習過后還有更多的機會能夠繼續(xù)計算流體力學方面的研究,同時我也會在接下來的學習中不斷充實自己的知識素養(yǎng),讓自己在數(shù)值計算方法的理論上更加扎實。
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